名偵探柯南劇場版︰純黑的惡夢

世界各國都發生了黑暗組織策動的暗殺事件，與此同時柯南一行人在水族館的雙輪式巨型摩天輪遇到一名受傷的神秘女子。她似乎失了憶，柯南等人決定要幫忙她找回記憶時，灰原發現那名女子有着異色瞳，擔心她的真實身分有可能是黑暗組織的第二號人物「蘭姆」。

另一方面，柯南原本要找尋機會向宿敵逼近，但那名女子在看着摩天輪時卻突然病發，並曝露了她是黑暗組織的一員。就在她被送入警察醫院戒護的不久後，FBI 和公安認為時機成熟出動了。

FBI 成員赤井調查得知日本警方手上的非官方臥底名單被盜。要是名單落入黑暗組織手裡，潛入組織的卧底公安．安室透與 CIA 成員水無怜奈的性命將受到威脅。柯南和赤井決定聯手追查這次事件，這時候，在旁的苦艾酒手機突然響起，在電話那頭下達命令的「那一位」竟然是⋯